📄 بيولوجيا النبات

A neofunctionalized flowering antagonist created an evolutionary contingency that channeled Solanaceae adaptation

تُظهر هذه الدراسة أن اكتساب وظيفة جديدة لمتوازٍ لبروتين "فلوريجين" ليصبح مضاداً للإزهار (SP5G) قد خلق حالة من الطوارئ التطورية وجهت تطور وقت الإزهار التكيفي عبر سلالات متنوعة من الفصيلة الباذنجانية من خلال الانتقاء المتكرر لطفرات محددة في الترميز والتنظيم الجيني أثناء كل من التكيف البري واستئناس المحاصيل.

Shohat, H., Ciren, D., Arrones, A., Gentile, I., Ramakrishnan, S., Hendelman, A., Jenike, K. M., Brown, N. L., Luna-Ramo (…)2026-02-21
📄 بيولوجيا النبات

Southern South American Maize Landraces: A Source of Phenotypic Diversity

تُظهر هذه الدراسة أن سلالات الذرة المحلية من شمال الأرجنتين تُبدي تنوعاً ظاهرياً وكيميائياً حيوياً كبيراً داخل وبين العينات، مع ارتباط هذا التباين بارتفاع موقع الجمع، مما يسلط الضيد على قيمتها كموارد جينية لتوسيع القاعدة الجينية لتربية الذرة الحديثة.

Dudzien, T. L., Freilij, D., Defacio, R. A., Fernandez, M., Paniego, N. B., Lia, V. V., Dominguez, P. G.2026-02-20
📄 بيولوجيا النبات

Haplotype-rich cis-regulation underlies transcriptomic diversity across the breeding history of maize (Zea mays)

على الرغم من الانخفاضات الكبيرة في التنوع النيوكليوتيدي نتيجة لاختناقات عمليات تربية الذرة، يظل التنوع النسخي محفوظاً إلى حد كبير من خلال التنظيم "سيس" (cis-regulation) متعدد الجينات والمدفوع بمتغيرات متعددة ذات تأثيرات صغيرة وهابلوتايبات متنوعة تخضع لعملية الانتخاب المنقي.

Grzybowski, M. W., Schnable, J. C.2026-02-20
📄 بيولوجيا النبات

TimeTraits: extracting functional traits from biological time-series in R

تعد TimeTraits حزمة برمجية بلغة R متاحة على مستودع CRAN، وهي تستخدم أساليب تحليل البيانات الوظيفية لاستخراج السمات الوظيفية من البيانات البيولوجية ذات السلاسل الزمنية، كما يتضح من خلال تطبيقها في تحليل تغيرات التلألؤ البيولوجي للساعة اليوماوية في نبات الأرابيدوبسيس عقب تحولات الفترة الضوئية.

Lock, S. C. L., Knight, M., Davis, S., Ezer, D.2026-02-20
📄 بيولوجيا النبات

A Novel Phenotyping Approach for Reconciling Precision and Variance in Disease Severity Estimates from High-resolution Imaging

تقدم هذه الدراسة إجراءً غير جراحي للنمط الظاهري القائم على الصور مع تقنية التحديد البؤري، والذي يعمل من خلال نمذجة شدة المرض كتوزيع بيتا كامن، على تحسين دقة التقديرات مع استيعاب التباين المكاني العالي في تجارب حقول القمح، مما ينقل عدم اليقين من أخطاء القياس نحو التباين المدفوع بيولوجياً.

Zenkl, R., McDonald, B. A., Anderegg, J.2026-02-20
📄 بيولوجيا النبات

Transformers Outperform ConvNets for Root Segmentation: A Systematic Comparison Across Nine Datasets

تقارن هذه الدراسة بشكل منهجي بين بنيات "ترانسفورمر" (Transformer) و"كونف نت" (ConvNet) عبر تسع مجموعات بيانات لتجزئة الجذور، كاشفةً أن النماذج القائمة على "ترانسفورمر"، لا سيما عند تدريبها مسبقاً، تتفوق بشكل كبير على نماذج "كونف نت" في الدقة ونقل النطاق، رغم أن اختيار مجموعة البيانات يفسر في النهاية تباين الأداء بشكل أكبر بكثير من بنية النموذج.

Smith, A. G., Lamprinidis, S., Seethepalli, A., York, L. M., Han, E., Mohl, P., Boulata, K., Thorup-Kristensen, K., Pete (…)2026-02-19
📄 بيولوجيا النبات

Alternative splicing expands the functional portfolio of a plant virus to control the viral cycle

تكشف هذه الدراسة أن فيروس تجعد أوراق الطماطم الأصفر (TYLCV) يستغل عملية التضفير البديل التي يتوسطها العائل لتوليد أشكال بروتينية متباينة من بروتين Rep، تعمل بشكل منفصل على دفع تضاعف الحمض النووي الفيروسي وتثبيط النسخ الفيروسي، مما يؤدي إلى حل الازدواجية الوظيفية لبروتين Rep وتحسين دورة العدوى الفيروسية.

Pott, D. M., Medina-Puche, L., Shi, C., Muelders, J. C., Wei, H., Lapczinsky, D., Yagci, Z., Ramasamy, R., Li, Y., Kuroi (…)2026-02-19
📄 بيولوجيا النبات

A deep-time landscape of plant cis-regulatory sequence evolution

من خلال تطبيق خوارزمية "كونسيرفاتوري" (Conservatory) على 284 نوعًا من النباتات، رسم الباحثون خرائط لما يقرب من 2.3 مليون تسلسل غير مشفر محفوظ عبر 300 مليون سنة من التطور، مما كشف أن العناصر التنظيمية "سيس" (cis-regulatory elements) القديمة تُعد حاسمة للتنظيم التنموي وتتبع مبادئ محددة من الاحتفاظ والفقدان وإعادة التنظيم أثناء إعادة الترتيب الجينومي.

Amundson, K. R., Hendelman, A., Ciren, D., Yang, H., de Neve, A. E., Tal, S., Sulema, A., Jackson, D., Barlett, M. E., L (…)2026-02-18
📄 بيولوجيا النبات

A scalable approach to inoculate plant viral vectors into plant tissue using non-pathogenic, transgenic galls

تُظهر هذه الدراسة إثبات مفهوم قابل للتوسع لاستخدام الأورام النباتية المعدلة وراثياً والناتجة عن بكتيريا *Agrobacterium tumefaciens* لإيصال النواقل الفيروسية النباتية، مثل فيروس عروق الحمضيات الصفراء المرتبط بالنوع الأول، بشكل جهازي إلى كل من نباتات النموذج والنباتات ذات الأهمية الاقتصادية مثل الحمضيات.

DeBlasio, S. L., Gao, F., Pang, Z., Igwe, D. O., Sullivan, S., Wang, Y.-H., Pitino, M., Coradetti, S., Simon, A., Heck (…)2026-02-18
📄 بيولوجيا النبات

Enhanced phenylalanine biosynthesis amplifies light-stress-driven phenylpropanoid production in Arabidopsis

تُظهر هذه الدراسة أن تعزيز التخليق الحيوي لـ L-phenylalanine يخفف من محدودية السلائف ويضاعف إنتاج الفينيل بروبانويد الناتج عن الإجهاد الضوئي في نبات الأرابيدوبسيس من خلال التنشيط التآزري لنشاط إنزيم phenylalanine ammonia-lyase.

Tiozon, R. J. N., Stolze, S. C., Harzen, A., Nakagami, H., Maeda, H. A., Fernie, A. R., Yokoyama, R.2026-02-18